近几年来，农民普遍都重视了有机菌肥的充分利用，但农民普遍反映充分利用商品有机菌肥后效果不明显，这到底是怎么回事？
    一、土壤菌肥不匹配
    土壤有酸碱之分，有机菌肥也是有pH值，菌又有真菌、细菌之分。中性和微酸性土壤宜施细菌性有机菌肥。碱性土壤宜施丝状微生物的藻类有机菌肥，充分利用后能固定空气中的氮，帮助果树充分利用其他状态存在的氮素养分。
    二、土壤理化性状恶化
    菌肥中的菌赖以生存的条件是有机质。而百分之八十以上的果园都是在充分利用无机化肥，土壤板结透气性差，促使一些厌气菌大量繁殖，如镰刀菌、齐整小核菌等。种植户施商品有机菌肥通常1亩都是在40公斤左右，有机质迅速被分解充分利用，有机肥中的菌种失去赖以生存的条件无法繁衍生存，大部分死亡。这就是种植户在充分利用商品有机菌肥中发现的地厚施有机菌肥有作用而地薄无作用的道理。
    三、土壤不利于微生物存活
    果园数年不施有机肥和浅施无机肥，导致土壤板结，存氧量差，根系生长缓慢。土壤pH值发生变化。除草剂在土壤中的残存直接破坏了土壤的团粒结构使土壤中的微生物死亡。果园充分利用有机菌肥后土壤中没有充足的微生物使菌肥发酵繁衍而形成有效的菌群，阻拦了肥效的发挥。果园要正确挑选除草剂，不仅要能除草，又在土壤中残存时间短，对土壤中微生物和土壤团粒结构没有太大的破坏。重视有机肥的充分利用，改良土壤得3～5年。